Por otra parte, criticaron duramente a la jueza federal de Caleta Olivia, Marta Yáñez, por permitir la filtración de documentos militares secretos, que aportó en la investigación de la tragedia del ARA San Juan. Por su parte, la Armada propuso querellar a la magistrada por esa actitud, pero el Gobierno prefirió no escalar el conflicto con la jueza Yañez.
Los dichos del gobierno, se dieron a conocer luego de que se confirmara que el submarino ARA San Juan, tenía la orden de hacer inteligencia sobre objetivos británicos. La difusión de la misión secreta que tenía el submarino argentino generó un fuerte cimbronazo entre en la Armada, el Gobierno y los familiares de los tripulantes.
